Между группами в любой семье пчелы различаются по наследственным особенностям отцов, будучи родными по матери. Полными сестрами женские особи могли бы быть в случае спаривания матки с трутнями одной отцовской семьи в зоне брачного полета. Разнородность отцовской наследственности пчел — обычное явление для каждой пчелиной семьи, в которой матка естественно спаривалась с трутнями в брачных вылетах. Эту особенность следует учитывать при выводе маток-дочерей от рекордисток
Трутни в результате партеногенеза (развития из неоплодотворенных яиц) не получают отцовских признаков. У них нет отца и не может быть сыновей, так как в неоплодотворенных яйцах заложена только материнская наследственная основа. В них половинный (гаплоидный) набор хромосом— 16. Оплодотворенное же яйцо, в котором произошло слияние мужской и женской половых клеток, характеризуется полным, диплоидным набором хромосом. Следовательно, отцовские признаки передаются только женским особям.
Рабочие пчелы, как и молодые матки, развиваясь в семье из оплодотворенных яиц, наследуют и материнские, и отцовские признаки. Численное соотношение дочерей внутри семьи по отцовскому происхождению разное, оно может меняться в течение сезона и по годам жизни матки. Это зависит от числа оплодотворенных яиц спермой каждого трутня, спарившегося с ней. Особенности расположения в семяприемнике доз спермы от каждого участвовавшего в спаривании трутня, определенная система регулирования продвижения половых клеток к откладываемым яйцам отражаются на особенностях родства женских индивидов. Выяснение их имеет большое значение для селекции пчел и вывода маток известного происхождения. Контролируемое наследование отцовских признаков обеспечивают с помощью метода инструментального осеменения маток, используя сперму трутней известного происхождения.